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宏基因组测序

【最新活动】新版《宏基因组微生物分类测序手册》下载

服务简介

宏基因组即生境中全部微小生物遗传物质的总和。它以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和测序分析为研究手段, 以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的。宏基因组学技术第一次使人类得以研究占环境中99%的不可培养的微生物种群,从而成为微生物研究的最前沿领域。对环境样本进行DNA提取后进行区域选择性扩增(如细菌16S V1-V9相应区域),再对扩增产物进行建库、测序,然后对所得的数据进行生物信息学分析。生物信息分析主要包括OTU的生成、取样充足性分析、丰度和多样性分析、菌群间差异分析、假设验证分析、进化树分析等。

技术支持

电话:021-57072083/57072062
Email:meta@sangon.com
           16s@sangon.com

主要流程

Miseq平台宏基因组测序

基因组DNA质检
16S/18S/ITS区域扩增
扩增产品定量混合
Miseq 2X300 bp测序
数据产出
生物信息分析
最终项目报告

ION TORRENT宏基因组测序

基因组DNA质检
16S/18S/ITS区域扩增
扩增产品定量混合
Emulsion PCR扩增
ION TORRENT测序
数据产出
生物信息分析
最终项目报告

订购信息

项目名称 内容 周期 价格
基因组DNA提取 宏基因组类样品基因组提取 1~5日 询价
16s-18s-ITS扩增服务 3~10日
高通量测序服务 Miseq 2X300或ION TORRENT平台,平均大于4万条序列/样品 3~5日
数据分析服务 10日

客户提供

提供样品

总DNA或者包装完好的原始样品(如土壤、粪便、水体和口腔物);样品名称清晰,冷藏运输。具体要求参看后附《高通量测序样品要求》。

提供信息

如有对照与实验样品的区分,讲明正常样品与实验样品,如有分组,详细描述分组分析信息,以及分组比较的分析需求信息。

最终交付

交付报告

测序原始数据
实验结果类文件
分析析报告以及分析结果文件。
部分发表文章用的方法描述性书写(定制性)。

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